MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN04

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013734	CTTT	2	8	8	15	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013734	CAGCA	2	10	22	31	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013734	GCC	2	6	61	66	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013734	ATC	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013734	A	7	7	85	91	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013734	ACA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013734	A	6	6	160	165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013734	A	7	7	175	181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013734	CGG	2	6	203	208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013734	CTAA	2	8	266	273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013734	GCC	2	6	285	290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013734	GTTTTT	2	12	315	326	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013734	T	8	8	322	329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013734	TC	3	6	336	341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013734	T	9	9	405	413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013734	ACA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013734	GAG	2	6	454	459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013734	AAC	2	6	465	470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013734	ATTAA	2	10	480	489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013734	GT	3	6	511	516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013734	GT	3	6	532	537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013734	GT	3	6	553	558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013734	GT	3	6	574	579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013734	GT	3	6	596	601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013734	TTA	2	6	640	645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013734	G	6	6	3999	4004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013734	AAC	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013734	T	6	6	4044	4049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013734	TGGC	2	8	4062	4069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013734	ATT	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013734	TAA	2	6	4156	4161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013734	ACA	2	6	5270	5275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013734	AAC	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013734	ATG	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013734	GTAG	2	8	6671	6678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013734	ACG	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013734	GACA	2	8	6703	6710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013734	TAA	2	6	6714	6719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013734	T	6	6	6753	6758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013734	CGA	2	6	6763	6768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013734	TAA	2	6	6804	6809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013734	ACT	2	6	6927	6932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013734	TAG	2	6	7718	7723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013734	GAA	2	6	8002	8007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013734	GCT	2	6	8008	8013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013734	ACT	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013734	TTC	2	6	8674	8679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013734	CTGCA	2	10	9539	9548	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013734	CGG	2	6	9552	9557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013734	TGCAG	2	10	9569	9578	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013734	AAT	2	6	9585	9590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013734	AAG	2	6	9736	9741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013734	CTT	2	6	9866	9871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013734	TGA	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013734	GAA	2	6	9902	9907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013734	ACTA	2	8	9941	9948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.